亚足联本赛季恢复了亚洲第三级别俱乐部赛事，称为亚足联挑战联赛(AFC Challenge League)，相当于十余年前的亚足联主席杯(AFC President's Cup)。

亚足联现有47个正式成员，分为西区25个和东区22个。挑战联赛规制是西区12队参赛，东区8队参赛。除协会系数排在西区和东区前六的足协外，其他协会均有球队进入挑战联赛正赛的可能性，途径包括：亚冠二级联赛附加赛的负方、根据协会排名直接进入挑战联赛的正赛以及通过挑战联赛预选赛进入正赛。

2024-25赛季，西区有12支正赛球队。印度的东孟加拉和巴林的麦纳麦国民通过第一类途径进入正赛，他们在亚冠二级联赛的附加赛中分别负于土库曼斯坦的阿什哈巴德的黄金时代和科威特的科威特体育。第二类途径的球队包括科威特的科威特阿拉伯、土库曼斯坦的阿尔卡达格、黎巴嫩的贝鲁特星、叙利亚的代尔祖尔富托瓦、孟加拉国的巴顺达拉国王、阿曼的锡卜、马尔代夫的马兹亚和巴勒斯坦的圣城新月。吉尔吉斯共和国的坎特''阿布迪什-阿塔''和不丹的帕罗通过预选赛进入正赛。

东区没有举行亚冠二级联赛的附加赛，因此没有第一类途径的参赛球队。由于中国澳门及文莱、东帝汶、关岛和北马里亚纳群岛没有球队获得牌照，东区仅有6支球队通过第二类途径直接进入正赛，分别是印度尼西亚的马都拉联、缅甸的掸邦联、柬埔寨的柴桢圣剑、中国台湾的南市台钢、老挝的万象小象和蒙古国的SP猎鹰。